給水總含鹽量TDS、需去除的主要離子(鈣、鎂、鈉、鉀、銨、硫酸根、重碳酸根、氯、氟、硝酸根和二氧化硅)的濃度，是反滲透系統(tǒng)設計的基本依據(jù)。
給水溫度對反滲透系統(tǒng)的產(chǎn)水量和脫鹽率影響很大，在相同操作壓力下，水溫每變化1℃，產(chǎn)水量相應變化3%。當溫度較低時，脫鹽率增加。
給水pH值亦對
反滲透系統(tǒng)的脫鹽率有影響，較低的pH值常使得產(chǎn)水電導偏高。此外，一般情況下，反滲透產(chǎn)水的pH值均小于進水的pH值。
給水濁度及污染指數(shù)SDI可以反映給水的污染程度，據(jù)此確定反滲透預處理工藝的復雜程度。較高的給水濁度（＞0.5NTU）及SDI15(＞3)會降低反滲透系統(tǒng)的產(chǎn)水通量、增加反滲透系統(tǒng)的清洗頻度并會降低膜元件的使用壽命。
給水中硬度較高時，為防止給水在反滲透膜元件中結垢，應在預處理系統(tǒng)中增加軟化工藝。
反滲透系統(tǒng)設計要點
強化預處理系統(tǒng)是保證反滲透系統(tǒng)良好運行的關鍵，預處理良好的系統(tǒng)，可增加反滲透設計產(chǎn)水通量，推薦使用超濾膜作為反滲透系統(tǒng)的預處理。
為提高反滲透系統(tǒng)的水利用率(回收率)并降低濃差極化，膜元件的排列應盡量多用串聯(lián)方式，少用并聯(lián)方式，要保證每支壓力容器的*大進水量小于3.6m3/h，*小濃水流量大于0.7m3/h，一級RO系統(tǒng)，每支4英寸膜元件的產(chǎn)水量不大于0.25m3/h，必要時可采用部分濃水回流設計。
反滲透系統(tǒng)的水利用率(回收率)設計上限取決于水中難溶鹽的飽和指數(shù)，在不加阻垢劑時，一般應保證反滲透濃水的朗格利爾指數(shù)LSI≤0。
反滲透系統(tǒng)的操作壓力取決于給水含鹽量(滲透壓)、水溫和產(chǎn)水通量。一般設計壓力范圍為7～16 bar，膜元件的*高耐壓為41.6 bar。